Hệ thống xử lý nước thải được vận hành theo mẻ và theo tính chất của nước thải mang về nhà máy
Hệ thống có cấu tạo các phần chính
- Công đoạn phá vỡ kết cấu nước thải (phá mẫu)
- Công đoạn xử lý hóa lý
- Công đoạn nuôi cấy vi sinh
- Chứa nước tại các hồ sinh học và điều hòa.